Les membres d'un commando de la CIA sont envoyés à Prague. Ils ont pour mission d'appréhender, lors d'une réception dans l'ambassade américaine, un espion ennemi qui s'apprête à dérober une disquette contenant la liste secrète des agents en Europe centrale.
Ethan Hunt, agent secret, est accusé de la mort des membres de son équipe. Fuyant le gouvernement responsable de ces assassinats, forçant la sécurité du quartier général de la CIA pour s’y introduire, cramponné au toit d’un TGV, Hunt va entamer une course poursuite infernale afin de découvrir l’incroyable vérité...
